El ginkgo suele ser bien tolerado y seguro cuando se toma en las dosis recomendadas. Sin embargo, en raras ocasiones pueden presentarse efectos secundarios como molestias leves en el estómago, dolor de cabeza, mareos o reacciones alérgicas en la piel. Si aparecen estos síntomas, se debe suspender el uso de ginkgo y consultar a un médico. Las personas que toman medicamentos anticoagulantes deben tener especial precaución, ya que el ginkgo puede afectar la coagulación sanguínea. Las mujeres embarazadas y en periodo de lactancia también deben consultar a su médico antes de tomar productos de ginkgo.