Ginkgo is over het algemeen goed te verdragen en veilig wanneer het in de aanbevolen doseringen wordt ingenomen. In zeldzame gevallen kunnen er echter bijwerkingen optreden, zoals milde maagklachten, hoofdpijn, duizeligheid of allergische huidreacties. Als je zulke symptomen ervaart, stop dan met het gebruik van Ginkgo en neem contact op met een arts. Wees extra voorzichtig als je bloedverdunnende medicijnen gebruikt, omdat Ginkgo de bloedstolling kan beïnvloeden. Ook zwangere vrouwen en vrouwen die borstvoeding geven, moeten voor gebruik van Ginkgo-producten hun arts raadplegen.